Tratando-se a Santa Casa da Misericórdia da instituição mais antiga de Aljustrel e atendendo à natureza da sua obra, entendeu a Mesa Administrativa dotá-la das insígnias que representassem, de acordo com as regras da heráldica das misericórdias, a sua história e a sua vida. Com esse propósito encomendou a sua criação ao Dr. José Bénard Guedes, um especialista nesta matéria e que foi o autor do brasão da União das Misericórdias Portuguesas.
Assim, desde Setembro de 2002, que a nossa instituição dispõe de um brasão, estandarte e selo branco próprios. O brasão é constituído por um escudo de ouro, cruz da Ordem de Santiago de púrpura, entre uma estrela de sete pontas de vermelho e uma rosa heráldica de sete pétalas do mesmo, botonada de ouro e apontada de verde; em chefe, pomba do Espírito Santo, de prata, animada, bicada, armada e nimbada de vermelho; o listel é de prata com a legenda em maiúsculas: "Santa Casa da Misericórdia de Aljustrel". O estandarte é branco, com aspa firmada de azul; bordadura de púrpura, cantonada de amarelo, com os cantos carregados do monograma MI ZA, de vermelho; a aspa carregada de um escudo circular, com as armas da Misericórdia envolvidas por um listel de prata com as letras em maiúsculo "Santa Casa da Misericórdia de Aljustrel"; Haste e lança de ouro; tem cordão e borlas de ouro e púrpura. O selo branco e carimbo são circulares, com as peças do escudo, sem indicação de cores e metais, tudo envolvido por dois círculos concêntricos, entre os quais corre a legenda em maiúsculas "Santa Casa da Misericórdia de Aljustrel".
BRASÃO
Escudo de ouro, cruz da Ordem de Sant'Iago da Espada de púrpura, entre uma estrela de sete pontas de vermelho e uma rosa heráldica de sete pétalas do mesmo, botonada de ouro e apontada de verde; em chefe, pomba do Espírito Santo, de prata, animada, bicada, armada e nimbada de vermelho.
Listel de prata, com a legenda em maiúsculas: "SANTA CASA DA MISERICÓRDIA DE ALJUSTREL"
Coroa mariana de ouro, rematada por um mundo e pomba.
ESTANDARTE
Branco, com aspa firmada de azul; bordadura de púrpura, cantonada de amarelo, com os cantos carregados do monograma M I ZA, de vermelho. A aspa carregada de um escudo circular, com as armas da Misericórdia envolvidas por um listel de prata com as letras em maiúsculo "SANTA CASA DA MISERICÓRDIA DE ALJUSTREL"
Haste e lança de ouro.
Cordão e borlas de ouro e púrpura.
SELO BRANCO
Circular, com as peças do escudo, sem indicação de cores e metais, tudo envolvido por dois círculos concêntricos, entre os quais corre a legenda em maiúsculas "SANTA CASA DA MISERICÓRDIADE ALJUSTREL".